Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARF3P61204 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARF3P61204 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARF3P61204 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARF3P61204 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARF3P61204 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARF3P61204 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARF3P61204 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARF3P61204 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARF3P61204 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARF3P61204 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARF3P61204 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARF3P61204 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARF3P61204 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARF3P61204 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARF3P61204 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARF3P61204 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF3P61204 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF3P61204 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF3P61204 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF3P61204 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF3P61204 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF3P61204 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF3P61204 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF3P61204 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF3P61204 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF3P61204 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF3P61204 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF3P61204 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF3P61204 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF3P61204 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF3P61204 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF3P61204 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF3P61204 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF3P61204 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF3P61204 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF3P61204 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF3P61204 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF3P61204 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF3P61204 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF3P61204 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF3P61204 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF3P61204 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms