Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBP60709 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBP60709 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBP60709 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBP60709 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBP60709 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBP60709 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBP60709 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBP60709 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBP60709 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBP60709 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBP60709 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBP60709 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTBP60709 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBP60709 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTBP60709 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTBP60709 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTBP60709 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBP60709 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBP60709 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBP60709 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBP60709 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBP60709 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBP60709 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms