Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms