Protein–RNA interactions for Protein: P59827

BPIFB4, BPI fold-containing family B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB4P59827 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFB4P59827 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFB4P59827 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFB4P59827 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFB4P59827 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFB4P59827 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFB4P59827 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BPIFB4P59827 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BPIFB4P59827 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BPIFB4P59827 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BPIFB4P59827 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BPIFB4P59827 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFB4P59827 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms