Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP6P59044 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP6P59044 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP6P59044 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP6P59044 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP6P59044 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP6P59044 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP6P59044 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP6P59044 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP6P59044 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP6P59044 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP6P59044 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP6P59044 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NLRP6P59044 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NLRP6P59044 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP6P59044 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP6P59044 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms