Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFAP3P55082 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFAP3P55082 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFAP3P55082 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MFAP3P55082 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MFAP3P55082 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFAP3P55082 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFAP3P55082 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFAP3P55082 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFAP3P55082 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFAP3P55082 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFAP3P55082 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFAP3P55082 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFAP3P55082 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms