Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEMP55040 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEMP55040 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEMP55040 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEMP55040 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEMP55040 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEMP55040 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEMP55040 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEMP55040 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEMP55040 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEMP55040 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEMP55040 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEMP55040 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEMP55040 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEMP55040 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEMP55040 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEMP55040 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEMP55040 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GEMP55040 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEMP55040 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEMP55040 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEMP55040 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEMP55040 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEMP55040 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEMP55040 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEMP55040 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEMP55040 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GEMP55040 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEMP55040 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEMP55040 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEMP55040 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEMP55040 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEMP55040 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEMP55040 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEMP55040 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEMP55040 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEMP55040 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEMP55040 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GEMP55040 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEMP55040 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEMP55040 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEMP55040 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEMP55040 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEMP55040 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEMP55040 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEMP55040 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GEMP55040 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms