Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC12A2P55011 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms