Protein–RNA interactions for Protein: P55000

SLURP1, Secreted Ly-6/uPAR-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLURP1P55000 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLURP1P55000 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLURP1P55000 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLURP1P55000 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLURP1P55000 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLURP1P55000 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLURP1P55000 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLURP1P55000 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLURP1P55000 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLURP1P55000 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms