Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD23BP54727 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms