Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YARSP54577 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YARSP54577 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YARSP54577 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YARSP54577 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YARSP54577 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
YARSP54577 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
YARSP54577 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
YARSP54577 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
YARSP54577 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
YARSP54577 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YARSP54577 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YARSP54577 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YARSP54577 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YARSP54577 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YARSP54577 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YARSP54577 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YARSP54577 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YARSP54577 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YARSP54577 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YARSP54577 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
YARSP54577 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
YARSP54577 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
YARSP54577 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
YARSP54577 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YARSP54577 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YARSP54577 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YARSP54577 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YARSP54577 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YARSP54577 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YARSP54577 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YARSP54577 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
YARSP54577 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YARSP54577 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YARSP54577 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YARSP54577 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YARSP54577 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YARSP54577 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YARSP54577 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YARSP54577 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YARSP54577 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YARSP54577 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YARSP54577 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YARSP54577 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YARSP54577 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YARSP54577 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YARSP54577 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YARSP54577 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YARSP54577 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YARSP54577 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YARSP54577 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YARSP54577 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YARSP54577 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YARSP54577 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YARSP54577 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YARSP54577 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YARSP54577 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YARSP54577 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YARSP54577 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YARSP54577 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YARSP54577 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
YARSP54577 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
YARSP54577 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YARSP54577 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YARSP54577 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YARSP54577 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YARSP54577 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YARSP54577 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
YARSP54577 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
YARSP54577 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YARSP54577 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YARSP54577 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YARSP54577 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YARSP54577 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YARSP54577 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms