Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN1P54253 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms