Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AP2S1P53680 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms