Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX1P52954 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX1P52954 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX1P52954 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX1P52954 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX1P52954 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX1P52954 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX1P52954 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX1P52954 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX1P52954 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX1P52954 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX1P52954 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX1P52954 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX1P52954 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX1P52954 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX1P52954 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX1P52954 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX1P52954 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX1P52954 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX1P52954 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX1P52954 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX1P52954 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX1P52954 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX1P52954 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX1P52954 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX1P52954 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX1P52954 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX1P52954 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX1P52954 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX1P52954 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX1P52954 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX1P52954 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX1P52954 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX1P52954 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX1P52954 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX1P52954 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX1P52954 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LBX1P52954 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LBX1P52954 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LBX1P52954 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LBX1P52954 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LBX1P52954 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX1P52954 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX1P52954 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX1P52954 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX1P52954 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX1P52954 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX1P52954 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX1P52954 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX1P52954 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX1P52954 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX1P52954 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX1P52954 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX1P52954 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX1P52954 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX1P52954 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX1P52954 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX1P52954 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX1P52954 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX1P52954 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX1P52954 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX1P52954 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX1P52954 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX1P52954 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX1P52954 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX1P52954 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LBX1P52954 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX1P52954 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX1P52954 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX1P52954 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX1P52954 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX1P52954 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX1P52954 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX1P52954 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX1P52954 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX1P52954 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX1P52954 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX1P52954 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX1P52954 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX1P52954 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX1P52954 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX1P52954 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBX1P52954 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX1P52954 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms