Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDST1P52848 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDST1P52848 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDST1P52848 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDST1P52848 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDST1P52848 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDST1P52848 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDST1P52848 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDST1P52848 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDST1P52848 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDST1P52848 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDST1P52848 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDST1P52848 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDST1P52848 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDST1P52848 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDST1P52848 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDST1P52848 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDST1P52848 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDST1P52848 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDST1P52848 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NDST1P52848 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDST1P52848 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDST1P52848 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDST1P52848 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDST1P52848 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDST1P52848 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDST1P52848 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDST1P52848 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDST1P52848 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDST1P52848 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDST1P52848 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDST1P52848 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDST1P52848 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDST1P52848 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDST1P52848 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDST1P52848 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDST1P52848 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDST1P52848 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDST1P52848 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDST1P52848 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDST1P52848 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDST1P52848 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDST1P52848 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDST1P52848 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDST1P52848 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDST1P52848 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDST1P52848 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDST1P52848 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NDST1P52848 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDST1P52848 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NDST1P52848 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDST1P52848 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDST1P52848 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDST1P52848 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDST1P52848 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDST1P52848 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDST1P52848 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDST1P52848 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDST1P52848 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDST1P52848 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDST1P52848 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDST1P52848 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDST1P52848 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDST1P52848 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDST1P52848 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDST1P52848 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDST1P52848 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDST1P52848 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms