Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA5P52803 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms