Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCN3P51790 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN3P51790 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms