Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU3F4P49335 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms