Protein–RNA interactions for Protein: P48736

PIK3CG, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CGP48736 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CGP48736 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms