Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTDSS1P48651 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms