Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP1P48552 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms