Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ARCN1P48444 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARCN1P48444 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARCN1P48444 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARCN1P48444 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARCN1P48444 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ARCN1P48444 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARCN1P48444 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARCN1P48444 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARCN1P48444 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARCN1P48444 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARCN1P48444 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARCN1P48444 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARCN1P48444 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARCN1P48444 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARCN1P48444 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARCN1P48444 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms