Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKN1BP46527 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms