Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACADSBP45954 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms