Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATA4P43694 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATA4P43694 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATA4P43694 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GATA4P43694 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GATA4P43694 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GATA4P43694 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GATA4P43694 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GATA4P43694 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GATA4P43694 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA4P43694 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA4P43694 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA4P43694 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA4P43694 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA4P43694 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA4P43694 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA4P43694 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA4P43694 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA4P43694 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA4P43694 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA4P43694 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA4P43694 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA4P43694 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA4P43694 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA4P43694 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms