Protein–RNA interactions for Protein: P43378

PTPN9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN9P43378 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN9P43378 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN9P43378 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms