Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGER2P43116 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTGER2P43116 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms