Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDSP41222 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDSP41222 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDSP41222 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDSP41222 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDSP41222 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTGDSP41222 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTGDSP41222 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms