Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL1P40616 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARL1P40616 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARL1P40616 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARL1P40616 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARL1P40616 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARL1P40616 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARL1P40616 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ARL1P40616 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARL1P40616 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARL1P40616 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARL1P40616 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARL1P40616 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ARL1P40616 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARL1P40616 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL1P40616 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARL1P40616 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARL1P40616 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARL1P40616 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARL1P40616 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARL1P40616 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARL1P40616 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARL1P40616 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARL1P40616 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARL1P40616 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARL1P40616 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARL1P40616 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARL1P40616 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARL1P40616 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARL1P40616 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARL1P40616 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ARL1P40616 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARL1P40616 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARL1P40616 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARL1P40616 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARL1P40616 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARL1P40616 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARL1P40616 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARL1P40616 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARL1P40616 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARL1P40616 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARL1P40616 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARL1P40616 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARL1P40616 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARL1P40616 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARL1P40616 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARL1P40616 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARL1P40616 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARL1P40616 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARL1P40616 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms