Protein–RNA interactions for Protein: P37020

GEF1, Anion/proton exchange transporter GEF1, yeastyeast

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GEF1P37020 SYM1YLR251W 594 nt5.34□□□□□ -1.55
GEF1P37020 YLR252WYLR252W 306 nt5.34□□□□□ -1.55
GEF1P37020 NNT1YLR285W 786 nt5.34□□□□□ -1.55
GEF1P37020 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt5.34□□□□□ -1.55
GEF1P37020 PBN1YCL052C 1251 nt5.34□□□□□ -1.55
GEF1P37020 NHX1YDR456W 1902 nt5.34□□□□□ -1.55
GEF1P37020 LST4YKL176C 2487 nt5.34□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YEH2YLR020C 1617 nt5.34□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YTA6YPL074W 2265 nt5.34□□□□□ -1.56
GEF1P37020 RDH54YBR073W 2877 nt5.34□□□□□ -1.56
GEF1P37020 ASM4YDL088C 1587 nt5.33□□□□□ -1.56
GEF1P37020 ERG11YHR007C 1593 nt5.33□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YDL050CYDL050C 372 nt5.33□□□□□ -1.56
GEF1P37020 RPP1AYDL081C 321 nt5.33□□□□□ -1.56
GEF1P37020 SLD5YDR489W 885 nt5.33□□□□□ -1.56
GEF1P37020 NTF2YER009W 378 nt5.33□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YFL015CYFL015C 495 nt5.33□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YLR257WYLR257W 966 nt5.33□□□□□ -1.56
GEF1P37020 VPS63YLR261C 327 nt5.33□□□□□ -1.56
GEF1P37020 MRPL44YMR225C 297 nt5.33□□□□□ -1.56
GEF1P37020 SWS2YNL081C 432 nt5.33□□□□□ -1.56
GEF1P37020 snR10snR10 245 nt5.33□□□□□ -1.56
GEF1P37020 VPS45YGL095C 1734 nt5.33□□□□□ -1.56
GEF1P37020 FAA1YOR317W 2103 nt5.33□□□□□ -1.56
GEF1P37020 NAT1YDL040C 2565 nt5.33□□□□□ -1.56
GEF1P37020 SYO1YDL063C 1863 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 RGL1YPL066W 1440 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 DPH6YLR143W 2058 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 LHP1YDL051W 828 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YDR157WYDR157W 402 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YAP6YDR259C 1152 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YER165C-AYER165C-A 357 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 SDL1YIL167W 633 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 PAM18YLR008C 507 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 PHO80YOL001W 882 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 RET3YPL010W 570 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 IZH3YLR023C 1632 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 BUD5YCR038C 1929 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 ASI1YMR119W 1875 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 PRM15YMR278W 1869 nt5.32□□□□□ -1.56
GEF1P37020 PIN4YBL051C 2007 nt5.31□□□□□ -1.56
GEF1P37020 PSY4YBL046W 1326 nt5.31□□□□□ -1.56
GEF1P37020 SPO23YBR250W 1572 nt5.31□□□□□ -1.56
GEF1P37020 MIX14YDR031W 366 nt5.31□□□□□ -1.56
GEF1P37020 NCB2YDR397C 441 nt5.31□□□□□ -1.56
GEF1P37020 GIM4YEL003W 336 nt5.31□□□□□ -1.56
GEF1P37020 UPF3YGR072W 1164 nt5.31□□□□□ -1.56
GEF1P37020 RPL16AYIL133C 600 nt5.31□□□□□ -1.56
GEF1P37020 UBI4YLL039C 1146 nt5.31□□□□□ -1.56
GEF1P37020 BER1YLR412W 825 nt5.31□□□□□ -1.56
GEF1P37020 DPB3YBR278W 606 nt5.31□□□□□ -1.56
GEF1P37020 NDC80YIL144W 2076 nt5.31□□□□□ -1.56
GEF1P37020 GDH2YDL215C 3279 nt5.31□□□□□ -1.56
GEF1P37020 PCA1YBR295W 3651 nt5.3□□□□□ -1.56
GEF1P37020 EXO70YJL085W 1872 nt5.3□□□□□ -1.56
GEF1P37020 AIM21YIR003W 2040 nt5.3□□□□□ -1.56
GEF1P37020 STE7YDL159W 1548 nt5.3□□□□□ -1.56
GEF1P37020 APC1YNL172W 5247 nt5.3□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YKL063CYKL063C 504 nt5.3□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YNL057WYNL057W 333 nt5.3□□□□□ -1.56
GEF1P37020 SHG1YBR258C 429 nt5.3□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YCL022CYCL022C 516 nt5.3□□□□□ -1.56
GEF1P37020 MDM36YPR083W 1740 nt5.3□□□□□ -1.56
GEF1P37020 PSP1YDR505C 2526 nt5.3□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 BOP2YLR267W 1713 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 SEC2YNL272C 2280 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 TMA64YDR117C 1698 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 PHR1YOR386W 1698 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 PEX10YDR265W 1014 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 CHZ1YER030W 462 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 TDA2YER071C 381 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 CGR1YGL029W 363 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 SAE2YGL175C 1038 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YHL049CYHL049C 816 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YJL119CYJL119C 324 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 RPA12YJR063W 378 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YLR334CYLR334C 381 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 AIM36YMR157C 768 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 SEC66YBR171W 621 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 MBA1YBR185C 837 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 NUP85YJR042W 2235 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 HDA2YDR295C 2025 nt5.29□□□□□ -1.56
GEF1P37020 MNN4YKL201C 3537 nt5.28□□□□□ -1.56
GEF1P37020 GDE1YPL110C 3672 nt5.28□□□□□ -1.56
GEF1P37020 VMA8YEL051W 771 nt5.28□□□□□ -1.56
GEF1P37020 SEN15YMR059W 387 nt5.28□□□□□ -1.56
GEF1P37020 YOL075CYOL075C 3885 nt5.27□□□□□ -1.57
GEF1P37020 IMH1YLR309C 2736 nt5.27□□□□□ -1.57
GEF1P37020 RPS29BYDL061C 171 nt5.27□□□□□ -1.57
GEF1P37020 SNA2YDR525W-A 240 nt5.27□□□□□ -1.57
GEF1P37020 YER034WYER034W 558 nt5.27□□□□□ -1.57
GEF1P37020 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt5.27□□□□□ -1.57
GEF1P37020 YHR213WYHR213W 597 nt5.27□□□□□ -1.57
GEF1P37020 COA3YJL062W-A 258 nt5.27□□□□□ -1.57
GEF1P37020 YAR062WYAR062W 597 nt5.27□□□□□ -1.57
GEF1P37020 YNL046WYNL046W 519 nt5.27□□□□□ -1.57
GEF1P37020 RPL18BYNL301C 561 nt5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.5 ms