Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM23P36406 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms