Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKAP35790 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKAP35790 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKAP35790 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKAP35790 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKAP35790 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKAP35790 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKAP35790 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKAP35790 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKAP35790 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKAP35790 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKAP35790 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKAP35790 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKAP35790 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKAP35790 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKAP35790 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKAP35790 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKAP35790 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKAP35790 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKAP35790 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKAP35790 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHKAP35790 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHKAP35790 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKAP35790 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKAP35790 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKAP35790 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKAP35790 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHKAP35790 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKAP35790 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKAP35790 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKAP35790 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKAP35790 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKAP35790 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKAP35790 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKAP35790 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKAP35790 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKAP35790 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKAP35790 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKAP35790 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKAP35790 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHKAP35790 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKAP35790 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKAP35790 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKAP35790 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKAP35790 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKAP35790 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKAP35790 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKAP35790 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKAP35790 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHKAP35790 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHKAP35790 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHKAP35790 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHKAP35790 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHKAP35790 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKAP35790 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKAP35790 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKAP35790 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKAP35790 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKAP35790 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKAP35790 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKAP35790 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKAP35790 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKAP35790 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKAP35790 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKAP35790 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHKAP35790 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHKAP35790 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms