Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACTN2P35609 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN2P35609 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms