Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPN7P35236 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms