Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP6P35125 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
USP6P35125 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP6P35125 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
USP6P35125 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP6P35125 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6P35125 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6P35125 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6P35125 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6P35125 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6P35125 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6P35125 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6P35125 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6P35125 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6P35125 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6P35125 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6P35125 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6P35125 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6P35125 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6P35125 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP6P35125 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP6P35125 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP6P35125 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP6P35125 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP6P35125 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP6P35125 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
USP6P35125 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP6P35125 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP6P35125 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP6P35125 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP6P35125 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP6P35125 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP6P35125 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP6P35125 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP6P35125 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP6P35125 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP6P35125 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP6P35125 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP6P35125 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP6P35125 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP6P35125 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP6P35125 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
USP6P35125 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP6P35125 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP6P35125 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
USP6P35125 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP6P35125 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP6P35125 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP6P35125 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP6P35125 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP6P35125 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP6P35125 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP6P35125 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP6P35125 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP6P35125 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP6P35125 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP6P35125 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP6P35125 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP6P35125 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP6P35125 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP6P35125 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP6P35125 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP6P35125 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP6P35125 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP6P35125 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP6P35125 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP6P35125 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP6P35125 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
USP6P35125 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP6P35125 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP6P35125 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP6P35125 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP6P35125 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP6P35125 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP6P35125 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP6P35125 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP6P35125 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP6P35125 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP6P35125 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP6P35125 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP6P35125 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP6P35125 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP6P35125 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms