Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms