Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR1P32246 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR1P32246 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR1P32246 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR1P32246 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR1P32246 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR1P32246 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR1P32246 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR1P32246 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR1P32246 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR1P32246 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR1P32246 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR1P32246 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR1P32246 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR1P32246 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR1P32246 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR1P32246 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR1P32246 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR1P32246 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR1P32246 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR1P32246 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR1P32246 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR1P32246 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR1P32246 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR1P32246 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR1P32246 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR1P32246 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR1P32246 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR1P32246 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR1P32246 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR1P32246 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR1P32246 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR1P32246 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR1P32246 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR1P32246 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR1P32246 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR1P32246 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR1P32246 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR1P32246 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR1P32246 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR1P32246 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR1P32246 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR1P32246 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR1P32246 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR1P32246 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR1P32246 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR1P32246 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR1P32246 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR1P32246 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR1P32246 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR1P32246 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR1P32246 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR1P32246 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR1P32246 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR1P32246 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR1P32246 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR1P32246 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR1P32246 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCR1P32246 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCR1P32246 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCR1P32246 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR1P32246 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR1P32246 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR1P32246 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR1P32246 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR1P32246 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR1P32246 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR1P32246 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR1P32246 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR1P32246 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR1P32246 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR1P32246 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR1P32246 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms