Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCKARP32238 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCKARP32238 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCKARP32238 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCKARP32238 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCKARP32238 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCKARP32238 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCKARP32238 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCKARP32238 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCKARP32238 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCKARP32238 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCKARP32238 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCKARP32238 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCKARP32238 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCKARP32238 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCKARP32238 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCKARP32238 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCKARP32238 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCKARP32238 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCKARP32238 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCKARP32238 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCKARP32238 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCKARP32238 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCKARP32238 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCKARP32238 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCKARP32238 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCKARP32238 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCKARP32238 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCKARP32238 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCKARP32238 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCKARP32238 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCKARP32238 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCKARP32238 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCKARP32238 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCKARP32238 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCKARP32238 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCKARP32238 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCKARP32238 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCKARP32238 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCKARP32238 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCKARP32238 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCKARP32238 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCKARP32238 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCKARP32238 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCKARP32238 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCKARP32238 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCKARP32238 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCKARP32238 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCKARP32238 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms