Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASQ1P31415 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms