Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 TMEM92-AS1-201ENST00000508851 750 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AC021546.1-201ENST00000518927 1031 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 IFNA14-201ENST00000380222 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AC004918.1-201ENST00000467537 770 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 KRTAP4-3-201ENST00000391356 964 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 WWOX-AS1-201ENST00000567099 443 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 ZNF30-AS1-201ENST00000604333 625 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AC112187.3-201ENST00000607844 408 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 ETFRF1-201ENST00000381356 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms