Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5DP30049 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms