Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms