Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRMP28827 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRMP28827 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
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