Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBL1P28749 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBL1P28749 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBL1P28749 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBL1P28749 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBL1P28749 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBL1P28749 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RBL1P28749 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBL1P28749 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBL1P28749 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RBL1P28749 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBL1P28749 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBL1P28749 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBL1P28749 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBL1P28749 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBL1P28749 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RBL1P28749 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBL1P28749 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBL1P28749 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RBL1P28749 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBL1P28749 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBL1P28749 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBL1P28749 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBL1P28749 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBL1P28749 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBL1P28749 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBL1P28749 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBL1P28749 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBL1P28749 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RBL1P28749 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBL1P28749 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBL1P28749 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBL1P28749 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBL1P28749 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBL1P28749 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBL1P28749 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBL1P28749 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBL1P28749 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBL1P28749 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBL1P28749 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBL1P28749 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBL1P28749 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RBL1P28749 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms