Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms