Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2CP28335 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2CP28335 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms