Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms