Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARK3P27448 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARK3P27448 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARK3P27448 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARK3P27448 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARK3P27448 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARK3P27448 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARK3P27448 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARK3P27448 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARK3P27448 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARK3P27448 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MARK3P27448 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARK3P27448 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARK3P27448 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARK3P27448 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARK3P27448 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARK3P27448 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARK3P27448 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARK3P27448 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARK3P27448 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARK3P27448 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARK3P27448 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARK3P27448 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARK3P27448 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARK3P27448 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARK3P27448 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARK3P27448 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARK3P27448 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARK3P27448 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARK3P27448 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARK3P27448 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARK3P27448 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARK3P27448 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARK3P27448 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARK3P27448 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARK3P27448 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARK3P27448 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARK3P27448 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARK3P27448 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARK3P27448 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARK3P27448 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARK3P27448 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MARK3P27448 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARK3P27448 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARK3P27448 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARK3P27448 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARK3P27448 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARK3P27448 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARK3P27448 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARK3P27448 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARK3P27448 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARK3P27448 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARK3P27448 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MARK3P27448 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARK3P27448 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARK3P27448 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MARK3P27448 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MARK3P27448 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARK3P27448 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARK3P27448 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARK3P27448 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARK3P27448 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARK3P27448 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK3P27448 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK3P27448 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK3P27448 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK3P27448 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK3P27448 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK3P27448 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK3P27448 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK3P27448 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK3P27448 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK3P27448 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK3P27448 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK3P27448 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK3P27448 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK3P27448 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK3P27448 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARK3P27448 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms