Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM3P25205 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM3P25205 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM3P25205 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM3P25205 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM3P25205 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM3P25205 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM3P25205 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM3P25205 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM3P25205 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM3P25205 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM3P25205 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM3P25205 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM3P25205 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM3P25205 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM3P25205 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM3P25205 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM3P25205 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM3P25205 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM3P25205 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM3P25205 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM3P25205 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM3P25205 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM3P25205 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM3P25205 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM3P25205 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM3P25205 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM3P25205 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM3P25205 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM3P25205 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM3P25205 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM3P25205 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM3P25205 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM3P25205 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM3P25205 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM3P25205 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM3P25205 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM3P25205 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM3P25205 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM3P25205 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM3P25205 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM3P25205 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM3P25205 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM3P25205 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM3P25205 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM3P25205 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM3P25205 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM3P25205 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM3P25205 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM3P25205 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM3P25205 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM3P25205 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM3P25205 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM3P25205 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM3P25205 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM3P25205 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM3P25205 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM3P25205 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM3P25205 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM3P25205 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms