Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACO1P21399 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACO1P21399 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACO1P21399 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACO1P21399 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACO1P21399 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACO1P21399 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACO1P21399 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACO1P21399 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACO1P21399 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACO1P21399 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACO1P21399 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACO1P21399 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACO1P21399 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACO1P21399 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACO1P21399 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACO1P21399 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACO1P21399 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACO1P21399 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACO1P21399 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACO1P21399 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACO1P21399 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACO1P21399 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACO1P21399 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACO1P21399 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACO1P21399 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACO1P21399 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACO1P21399 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACO1P21399 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACO1P21399 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACO1P21399 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACO1P21399 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACO1P21399 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACO1P21399 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACO1P21399 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACO1P21399 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACO1P21399 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACO1P21399 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACO1P21399 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACO1P21399 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACO1P21399 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACO1P21399 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACO1P21399 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACO1P21399 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACO1P21399 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACO1P21399 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACO1P21399 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACO1P21399 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACO1P21399 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACO1P21399 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACO1P21399 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACO1P21399 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACO1P21399 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACO1P21399 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms